Планово-финансовый отдел является структурным подразделением университета и подчиняется ректору, осуществлять экономическое планирование деятельности КНАУ и повышение экономической эффективности использования финансов. В своей деятельности ПФО руководствуется действующим законодательством,  законом КР «Об образовании», положением о ВУЗе,  указами Президента КР, приказами и распоряжениями Министерства образования и науки КР уставом КНАУ,Положением о бухгалтерском учете и отчетности в КР, Налоговым Кодексом КР, приказами и распоряжениями ректора  КНАУ и другими нормативными актами.

Основными задачами планового – финансового отдела являются:

• участие в перспективном и текущем планировании подготовки специалистов по бюджету и внебюджетным средствам.
• планирование и организация финансовой деятельности КНАУ
• составление перспективных и ежегодных смет доходов и расходов
• разработка тарификационного списка и штатного расписания
• обеспечение (совместно с другими службами) правильного и эффективного использования трудовых и денежных ресурсов, выделяемых на содержание КНАУ, финансовых поступлений за обучение студентов на внебюджетных отделениях.